目前，我國水污染程度較深、治理難度較大，涉及水污染的突發(fā)事件頻發(fā)。專(zhuān)家建議，應盡快由權威機構對水污染狀況進(jìn)調查、建立協(xié)調機構改變水污染治理多頭管理的現狀，從制度上扭轉GDP政績(jì)觀(guān)，并從源頭抓起不斷前移防污治污關(guān)口，不斷加大水污染治理投入力度。
　　中國人民大學(xué)環(huán)境學(xué)院院長(cháng)馬中、山東大學(xué)環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院副院長(cháng)張建等人認為，全面了解我國水質(zhì)污染狀況的分布、程度及主要污染物，是進(jìn)一步科學(xué)防污治污的基礎，應由權威機構組織相關(guān)科研單位和人員進(jìn)行全國范圍內進(jìn)行一次調查統計。
　　多位環(huán)保行業(yè)專(zhuān)家學(xué)者認為，環(huán)境紅利是我國能保持續多年經(jīng)濟高增長(cháng)的原因之一，但目前一些地方的水污染狀況已逼近極限，改變GDP政績(jì)觀(guān)、妥善處理經(jīng)濟發(fā)展與環(huán)保關(guān)系迫在眉睫。
　　陜西省政協(xié)人口資源環(huán)境委員會(huì )副主任司全印建議，國家應該根據資源與環(huán)境的容量，反推出環(huán)境能容納的GDP增幅，由此設定GDP發(fā)展的環(huán)境上限。同時(shí)還應測算出治理污染與經(jīng)濟發(fā)展的關(guān)聯(lián)圖，分別描述GDP保持不同增速時(shí)，我國的環(huán)境會(huì )出現怎樣的態(tài)勢。
　　公眾與環(huán)境研究中心主任馬軍說(shuō)，在短期內從根本上改變GDP導向指揮棒的難度很大，因此還要通過(guò)制度上制約地方政府的行為。首先要推進(jìn)環(huán)境信息實(shí)時(shí)公開(kāi)，制約地方政府對環(huán)境執法和環(huán)境訴訟的干擾；其次是強化地方黨政“一把手”的環(huán)保職責，要改革考核政績(jì)的傳統模式，實(shí)現環(huán)境保護一票否決制；還應打造要公眾深度參與環(huán)保公共事務(wù)的平臺，讓公眾對環(huán)保公共事務(wù)的每一次投訴或舉報件件有著(zhù)落，第一時(shí)間處理，第一時(shí)間回復，讓公眾的監督落到實(shí)處。
　　《經(jīng)濟參考報》記者在多地采訪(fǎng)了解到，水資源綜合管理沒(méi)有統一的管理體制、水污染治理多部門(mén)，成為當前治污防污的難點(diǎn)之一。目前與水質(zhì)污染與治理相關(guān)的有水務(wù)、環(huán)保、國土、住建、地質(zhì)等多個(gè)部門(mén)，這就造成管理權責不清、管理盲區較多的混亂局面。以與水污染密切相關(guān)的水源地管理為例，目前城市與農村、地表水與地下水、水量與水質(zhì)等管理割裂，多龍治水、政出多門(mén)的現象普遍存在，造成水源地不管供水、供水不管排水、排水不管治污、治污不管回用的現狀。水資源開(kāi)發(fā)利用管理無(wú)序，水資源浪費嚴重。
　　對此，北京大學(xué)水資源研究中心教授鄭春苗、安徽省環(huán)境監察局局長(cháng)黃建樹(shù)等人建議，水污染防治工作不能頭痛醫頭腳痛醫腳，環(huán)保問(wèn)題是一個(gè)社會(huì )問(wèn)題，涉及經(jīng)濟、社會(huì )、文化、政治等多個(gè)領(lǐng)域，不是僅僅依靠環(huán)保部門(mén)解決污染問(wèn)題。因此不僅要從治理企業(yè)排污等微觀(guān)層面考慮，更應當全面考量，比如從區域工業(yè)布局、產(chǎn)業(yè)產(chǎn)能轉移等宏觀(guān)層面上考慮。因此應盡快從法律角度對水污染治理明確權責，交由統一部門(mén)進(jìn)行協(xié)調管理。
　　多位環(huán)保界人士認為，近年來(lái)我國水污染的總體趨勢是工業(yè)污水控制較嚴格、農業(yè)污染危害漸顯、生活污水不斷增加。對此，過(guò)去邊污染邊治理的治理模式，在新形勢下必須轉變?yōu)閷⑺�污染防治關(guān)口前移，從源頭控制污染源。
　　貴州省環(huán)保廳副廳長(cháng)姜平、陜西省延安市環(huán)保局副局長(cháng)郝明建等人建議，要繼續強化環(huán)境審批，嚴格環(huán)境準入，建立起有力的源頭防控體系。其中在關(guān)口前移時(shí)應分層次分區域進(jìn)行，首先是對長(cháng)江、黃河、淮河等流域水污染嚴重、環(huán)境問(wèn)題突出的地區進(jìn)一步加化流域限批，特別是對重點(diǎn)流域的高污染項目實(shí)行“禁入制”。其次要對現有落后產(chǎn)能的淘汰也要實(shí)行源頭控污。對高污染的項目、不符合產(chǎn)業(yè)政策和減排要求的項目不予批準建設，從源頭上杜絕新的水污染源的產(chǎn)生。
　　全國人大代表王學(xué)求認為目前我國對水污染防治資金的投入力度還需繼續加大，應該通過(guò)法律規定水污染防治的投入在國民經(jīng)濟生產(chǎn)總值中的所占比例，并以法律形式把政府用在治污防污的基礎設施、數據調查與監測、公共污染事件應急處理、環(huán)保應用技術(shù)研究等方面的基本投入固定下來(lái)，該是政府投入的要足額確保，并對無(wú)法落實(shí)投入的部門(mén)和個(gè)人進(jìn)行問(wèn)責。
　　山東省平原縣環(huán)保局副局長(cháng)張朝清、陜西省西安市環(huán)保局水污染控制處處長(cháng)趙金玉等人建議，在農村必須推行以改善農業(yè)生態(tài)環(huán)境、加快農村經(jīng)濟發(fā)展為主要內容的生態(tài)農業(yè)生產(chǎn)體系。把現代化科學(xué)技術(shù)和傳統農業(yè)精華有機結合起來(lái)，逐步增加有機肥料的使用，減少化肥、農藥的使用。同時(shí)開(kāi)發(fā)生物農藥技術(shù)，推廣以菌治蟲(chóng)、以蟲(chóng)治蟲(chóng)的生物技術(shù)替代農藥。并逐步把農村富余勞動(dòng)力從污染型鄉鎮工業(yè)轉移到生態(tài)農業(yè)建設上來(lái)。